芳香疗法的起源可以追溯到古代文明。人们经常聚集在祭祀仪式所使用的炉火旁，嗅闻木材，枝叶与树脂散发的圣洁香味，他们相信香味可驱除心灵和身体中的恶魔。古代的芳香疗法绝对多数采用熏蒸法，常用于治疗一些常见性疾病，传染病和慢性病。人们将各种珍贵的香料透过烟熏献给神灵表示对神灵的敬畏，期待得到平安。这种通过香水或熏香来提升个人精神层次和智慧并非迷信或是原始的行为。这种现象属于一种下意识的转移，进行冥想瑜伽或服用迷幻药会比较容易进入此种状态。这种感受源自大脑的边缘系统。边缘系统具有内脑脏之称，是内脏功能和机体内环境的高级调节控制中枢，也是情绪，情感的调节中枢。近德国科学家发现早被古人用来熏香的乳香树脂，含有一种成为氢化大麻醇的化学物质，这种物质由熏烧乳香而被释放出来，具有星峰精神的作用。

在中国古代，将药草，针灸，按摩一并用于治疗各种疾病的中国人者迷于长生不老的炼丹术。这些术士在炼丹之前会先熏香，并沐浴于有香味的水中。他们相信芳香植物的萃取精华偶神奇的力量，能够协助他们炼制出不老仙丹，他们也相信这种技术能够修持出更加完美的灵气。

芳香疗法在中国的应用由来已久，三国时期的神医华佗就用丁香，丁香油等制成小巧玲珑的香囊，悬挂在病人的居处，可以质量肺痨，吐泻等症。较早的芳疗是把香料制成饼块，放在一种特质的香炉内焚烧。所以我过出土的古尸千年不腐，其中也有龙脑，安息香等香料的功劳。